Lantai dua museum terdapat loteng paduan suara di mana terdapat kursi paduan suara berbahan kayu Molave. Di sebelah kiri atas terpajang orgel barok tua berhiaskan tiga patung malaikat bersayap yang menyatu dengan langit-langit Trompe-l’ ceil lukisan dua seniman Italia, Cesare Alberoni dan Giovanni Dibella.
Pada bagian tengah loteng paduan suara itu terdapat buku partitur tua dengan kertas berwarna kecokelatan. Ruang paduan suara tersebut menghadap langsung ke ruang kebaktian utama dengan altar dihiasi enam pilar dan tiga lampu kristal gantung.
Tiket Masuk Museum San Agustin
Dewasa PhP200 (Rp55.500)
Pelajar Php160 (Rp44.500)*
(Siska Maria Eviline)