Jus jeruk, cranberry, dan nanas termasuk minuman yang sebaiknya tidak dicampur dengan protein powder. Tingkat keasaman yang tinggi dapat membuat whey protein mengalami koagulasi atau menggumpal.
Selain mengubah tekstur minuman, pencampuran protein dengan jus asam tertentu dapat memengaruhi proses pencernaan dan penggunaan protein oleh tubuh. Kandungan antioksidan dalam jus juga berpotensi ikut berkurang.
Minuman energi maupun soda berkarbonasi bukan pilihan yang ideal sebagai dasar protein shake. Karbonasi dapat membuat minuman menjadi terlalu berbusa dan berpotensi menimbulkan keluhan pencernaan seperti gas dan kembung.
Di luar campurannya dengan protein powder, konsumsi minuman energi juga perlu diperhatikan karena dapat dikaitkan dengan efek seperti sulit tidur, rasa gelisah, dan gangguan pencernaan.
Protein shake tentu bukan pasangan yang ideal untuk minuman beralkohol. Mencampurkan protein powder dengan alkohol berpotensi menghilangkan manfaat yang ingin didapat dari protein shake. Konsumsi alkohol secara berlebihan sendiri juga memiliki berbagai risiko kesehatan.