Teori utama penyebab anomali menawan ini melibatkan zygomaticus mayor, otot yang membentang dari tulang pipi ke sudut mulut dan mengangkat sudut itu saat Anda tersenyum.

Pada manusia tanpa lesung pipi, zygomaticus mayor adalah satu pita yang berkelanjutan. Namun di beberapa orang yang berlesung pipi, para peneliti menemukan bahwa adanya otot bercabang di dekat mulut. Ketika mereka tersenyum lesung pipi muncul di tempat zygomaticus mayor ganda atau bifid yang terbelah.
Tetapi para peneliti juga belum memastikan zygomaticus menjadi penyebab terhadap semua lesung pipi. Ada kemungkinan juga bahwa variasi otot wajah lain dapat memengaruhi pembentukan lesung pipi.
Bagaimana seseorang memiliki otot wajah yang tidak biasa dan membentuk lesung pipi juga masih belum bisa terjawab. Orangtua yang memiliki lesung pipi berkemungkinan anaknya juga akan memiliki lesung pipi.