Secara kesehatan, mengonsumsi tempe sehari-hari, mendatangkan beberapa manfaat kesehatan bagi tubuh yakni;
1. Memenuhi kebutuhan protein dalam tubuh: Sama seperti tahu, susu kedelai, dan edamame, tempe menyediakan protein lengkap yang mana sebetulnya jarang ditemukan dalam makanan nabati.
2. Prebiotik ramah usus: Ahli gizi Deborah Murphy menjelaskan meski tempe adalah makanan fermentasi, namun tempe masih merupakan sumber prebiotik yang baik, yang memberi makan bakteri menguntungkan di usus manusia. Selain itu, proses fermentasi juga meningkatkan ketersediaan nutrisi tertentu dalam tempe, seperti zat besi, riboflavin, niasin, biotin, folat, dan vitamin B6.