Stasiun Maguwo Lama terletak di Desa Maguwoharjo, Kecamatan Depok, Sleman, Yogyakarta. Stasiun tersebut saat ini sudah tidak aktif, karena digantikan dengan bangunan stasiun baru yang berada di sebelah timur, kurang lebih 100 meter dari letak stasiun lama. Stasiun Maguwo yang aktif hingga sekarang, dibangun di kawasan Bandara Adisucipto yang sudah terintegrasi.
Stasiun Maguwo lama memiliki sejarah yang sangat panjang, hampir seperti stasiun Lempuyangan Yogyakarta yang masih aktif hingga sekarang.
Pembangunannya hampir bersamaan, yaitu sekira tahun 1870, ketika jalur Yogyakarta terintegrasi dengan jalur kereta api dari Semarang, melewati Surakarta. Dahulu, Stasiun Maguwo Lama tidak seperti sekarang ini berupa bangunan permanen yang sudah tertutup, tetapi hanya bangunan semi permanen menggunakan kayu sebagai tempat transit kereta api saja. Berbeda dengan Stasiun Lempuyangan yang memang sejak awal digunakan untuk stasiun kereta api dan tempat langsir lokomotif.
Peresmian dan pengoperasian secara total stasiun ini dilakukan bersamaan dengan beroperasinya jalur Semarang-Surakarta-Yogyakarta pada tanggal 21 Mei 1873. Sejak saat itu, pengoperasian kereta api di Yogyakarta dimulai, dengan stasiun Lempuyangan dan halte Maguwo sebagai dua stasiun yang melingkupi transportasi kereta api.
Pada mulanya Stasiun Maguwo dibangun untuk keperluan perkebunan, digunakan untuk transit kereta api yang akan keluar dan masuk pabrik gula Wonocatur. Halte Maguwo awalnya hanya digunakan sebagai transit kereta api untuk pengangkutan ke pabrik gula Wonocatur.
Keistimewaan Stasiun Maguwo Lama terdapat pada masa pemerintah Hindia-Belanda, pada masa itu stasiun ini diapit oleh jalur kereta api yang berbeda pengoperasian dan kepemilikannya. Jalur kereta sebelah selatan stasiun milik perusahaan swasta NISM (Nederlandsch Indisch Spoorweg Maatschapijj) dengan ukuran lebar rel (spoor) 1435 mm dan 1067 mm. Sedangkan sebelah utara adalah jalur milik perusahaan kereta api Negara SS (staatspoor en Trawegen) dengan lebar rel (spoor) 1067 mm. Jalur milik SS ini adalah jalur kereta api cepat dengan rute Jakarta-Surabaya.