Selain dengan snorkeling, Anda dapat menikmati pemandangan bawah laut dengan menggunakan boat beralas kaca yang memulai tour di jembatan sebelah utara pantai. Dengan membayar Rp250 ribu per trip di perahu berkapasitas 10 orang, Anda sekeluarga dapat menikmati warna-warni koral dan beragam ikan di sekeliling Pulau Rubiah.
Tour di atas perahu ini memakai waktu sekira 45-60 menit dipandu oleh para guide yang familiar dengan peta di bawah laut di seputar Pulau Rubiah.
Para pemandu hanya akan mengarahkan perahu ke lokasi yang kaya dengan kehidupan bawah laut. Di tengah-tengah tour, Anda akan diturunkan di Pulau Rubiah untuk menikmati pemandangan pulau atau snorkeling dan berenang selama yang Anda inginkan. Jika Anda mengambil tour boat kaca ini, sangat diajurkan berhenti dan snorkeling di Pantai Pulau Rubiah. Akan tetapi di puncak masa liburan, sebaiknya berhati-hati karena banyaknya perahu yang berlalu lalang di sekitar pantai pulau ini.